Inhoud

1 FOKschaap Rosetta@home handleiding
2 Install stappenplan
3 links
4 Problemen? Vragen?

FOKschaap Rosetta@home handleiding

Rosetta@home is een wetenschappelijk onderzoekproject dat internet-verbonden computers gebruikt om eiwitstructuren te voorspellen en te ontwerpen, en eiwit-eiwit en eiwit-ligand-eiwitinteractie. Het doel is methodes te ontwikkelen die voorspellen en nauwkeurig eiwitstructuren en complexen, een inspanning ontwerpen die onderzoekers kan uiteindelijk helpen behandelingen voor menselijke ziekten (zie Human Proteome Folding Project, een samenwerkingsinspanning om onze software op het menselijke genoom toe te passen) te ontwikkelen. Het project vertrouwt op individuen die hun computer rekencapaciteit schenken, om zo methodes te ontwikkelen deze testen en te verbeteren.

Install stappenplan

Stap 1
Ga naar Rosetta mainsite en klik op 'create account'. Directe link is: account aanmaken
Kies een nickname en vul deze als volgt in [DPC]FOKschaap~nickname verder krijg je nog je Email Address, Password het normale gedoe dus (je kunt later eventueel je nick nog veranderen, let wel op het is hoofdlettergevoelig. Alle instellingen van je account kun via de website veranderen. We gaan nu even je TEAM instellen, bij account statistics klik je op 'find a team'. Vul Dutch in en zoek, hij vind dan: Dutch Power Cows, klik deze aan.

Stap 2
Download de BOINC client software van de Rosetta mainsite, directe link: BOINC download en kies een systeem. Je ziet daar ook een install handleiding staan.

Stap 3 (Windows install)
Maak een map aan voor BOINC (bv C:\Program Files\BOINC) en gooi het gedownloade bestand daarin. Start de install

Stap 4
Na de standaard install zooi, krijg je de keuze uit 3 verschillende installaties, Single-user installation,Shared installation en Service installation. Bij de Single-user draait BOINC alleen voor de user die het installeerd. De Shared version draait bij alle gebruikers op je computer (als hij bij 'start opstarten' staat en anders is BOINC te zien in startmenu). Bij Service installation draait ie altijd (ook bij geen ingelogde gebruiker).

Stap 5
Als BOINC geinstalleerd is kun je eventueel de taal veranderen bij Opties-algemeen-taalselectie. Verder moet je ook nog een project toevoegen, in dit geval dus Rosetta@home. Start BOINC en ga naar 'Projecten' - 'Projecten toevoegen'. klik op 'volgende' en dan gooi de de url van Rosetta erin: http://boinc.bakerlab.org/rosetta/ . Bij het tabblad zie je dan Rosetta@home verschijnen.

Stap 6
Ga dan wat jobs inladen. Bij het tabblad 'werk' krijg je een queue te zien met 1 of 2 jobs die bezig zijn.

Als hij geen jobs binnen kan halen check dan even het tabblad 'berichten', als daar staat: 'not enough disk space' dan gaan we deze even toekennen. Hij heeft namelijk een minimale hoeveelheid nodig van 200MB, niet dat hij deze ook maar gebruikt. Ga naar je gebruiker instellingen via de website http://boinc.bakerlab.org/rosetta/home.php, bij 'general preferences' verander je de bij 'Disk and memory usage' in bijvoorbeel 240 (als het maar meer is dan 200). 1 opmerking er staat Gbytes maar waarschijnlijk is het MB.

Diverse aan/opmerkingen
Voor HT users, bij de gebruiker instellingen, 'general preferences', 'processor usage' zie je als het goed is 2 processors staan, je kunt dan 2 jobs tegelijk runnen.

Queue instellen?? Bij je 'instellingen - network usage' staat: connect to network about every
Dit geeft aan hoevaak BOINC contact maakt om jobs in te laden, dus hoe minder vaak des te groter je ingeladen queue zal zijn.