FAHhandleiding

Folding@Home

Het doel van Folding@Home is het simuleren van hoe eiwitten folden, misfolden, aggregatie van eiwitten en de hieraan gerelateerde problemen.Het doel is meer te weten komen over eiwitten. Voornamelijk over wat ze doen en hoe ze vouwen(folden). Eiwitten zijn de werkpaarden van het lichaam, maar voordat ze kunnen werken moeten ze zich op een bepaalde manier rangschikken, het zogenaamde ordenen, folden. Dit folden is fundamenteel voor alle biologische wezens, maar als kennis voor de mens eigenlijk bijna een compleet mysterie. Dit folden gebeurt constant in het lichaam, maar het gebeurt wel eens dat dit misgaat, het zogenaamde misfolden. Soms is er niks aan de hand als dat gebeurt maar het kan ook gebeuren dat, dat wel zo is. Een aantal ziektes zijn gerelateerd aan dit misfolden, bijvoorbeeld Alzheimer's, BSE(mad cow) , CJD(Creuzfeld Jacobs Disease), ALS en Parkinson's.

Client

Er zijn clients voor Windows, Linux, MacOSX en met aanpassing ook voor NetBSD en OpenBSD. De systeemeisen:De minimale systeemeisen voor een pc die gemiddeld 10 uur per dag aanstaat is een Intel Pentium 2 500Mhz (of vergelijkbaar) met 64mb ram. Zo'n pc zou net alle deadlines moeten kunnen halen. Aangeraden wordt wel om langzame pc's op de zogenaamde "timeless units" projecten te zetten.

Registratie Om deel te nemen aan folding@home is het niet nodig te registreren. Het eenmalig invullen van je gegevens (bij installatie van de client) is voldoende. Vul je een nieuwe naam in, dan ziet stanford dat en wordt er automatisch een nieuwe user geregistreerd. Hier hoef je verder niets voor te doen.

Om te verifieren of je nieuwe subteam goed is ingevoerd, zul je moeten wachten op de statistieken van de dag nadat je je eerste werk (workunit) teruggestuurd hebt naar de server. In deze statistieken zul je dan je subteam's naam terug kunnen vinden.

Problemen? Vragen?

MSN: IRC: irc.tweakers.net #fokschaap of gebruik applet
of vraag op het forum

Install stappenplan

Hier een 'eenvoudige' handleiding hoe je FaH installeert en hoe je je moet aanmelden bij FOKschaap.

Stap1 download de client: Download de software van http://folding.stanford.edu/download.html er zijn diverse clients voor elk opperating system, dus let op!
Stap2 start het programma, de 1e 3schermen dienen als welkom/voorwaarden bij het 4e scherm wordt gevraagd een naam op te geven. Om bij het subteam Fokschaap te komen doe je het volgende: [DPC]_Fokschaap0nick
Het 5e scherm vraagt waar het programma geinstalleerd moet worden. Het installeren is klaar, je zal in de statistieken verschijnen zodra er 1 unit af en opgestuurd is. Voor details van je huidige status van de client te zien klik je op rode bloem in je systemtray (meestal rechtsonder in taakbalk).

Verdere instelling kunnen aangepast worden in het Folding@Home control panel
systemtray, configure, user, teamnummer -> vul bij teamnummer 92 in voor DPC

Bij advanced kun je instellen hoeveel % van je CPU gebruikt wordt.

Dual en HTT systemen

Folding@Home biedt ondersteuning voor meerdere fysieke of logische cpu's. Dit gaat alleen niet vanzelf. Om hiervan volledig gebruik te maken ben je verplicht tot het runnen van 1 console per fysieke of logische core. Stop de client in een aparte map. Herhaal dit voor elke logische of fysieke cpu die er in jouw systeem zit. Dat komt bijvoorbeeld neer op 2 mappen voor een P4 3.2Ghz en 4 mappen voor een Dual Xeon 2.8Ghz.Nadat de client in alle mappen aanwezig is kan deze worden gestart. Let op! Tijdens de installatie wordt gevraagd om een "MachineID". Dit moet in elke map een ander nummer zijn: 1 t/m 8. Bij een andere pc kan je gewoon weer met een schone lei beginnen.

Installing for big work units

To receive big work units you need to use the advmethods switch and enable receipt of big work units in the client.

Graphical Client:

  1. Follow steps 1-5 of Standard Installation  Graphical Client if you havent already. If you have already installed the graphical client follow on from the next step.
  2. Open the F@H configuration, click on the connections tab, you should see this:
  3. Check the line that says Allow receipt of work assignments and return of results greater than 5 MB in size, so that there is a tick next to it. Click ok.
  4. Close the F@H client.
  5. Find the shortcut that opens F@H client for you. If you have performed a default install this will be in your Startup folder (Start->Programs->Startup). Right click the shortcut and open the properties, youll see something like this:
  6. In the target line change C:\Program Files\Folding@Home\WinF@H to C:\Program Files\Folding@Home\WinF@H advmethods
  7. Click apply, then OK
  8. Open the F@H client again, using the shortcut that you just added advmethods to. You are now ready to receive big work units!!!

Monitor progs

Electron Microscope, is een programma voor het monitoren van F@H, maximaal 50 clients. Het geeft details en status van elke client die FAH draait.
Electron Microscope III
EM3 install help

Links

Stats

F@H DPC site
Marcelloz stats F@H

Stanford all teams stats(updates every hour)
Stanford DPC fast stats (updates every 3 hours)
Stanford DPC stats(updates every hour)
Stanford individual stats(updates every hour)
Extreme all teams stats(updates every 3 hours)

Overig

http://folding.stanford.edu/download.html
http://www.foldingathome.nl
http://fahwiki.net/index.php
http://fahwiki.net/index.php?title=FAQ
http://pr0ner.no-ip.org/dpc/folding.xml
Megaflushen
http://forum.teamcoldfusion.nl/viewtopic.php?t=994#9240

Wiki-pagina's

FOKschaap met FAD info
OP/FOKschaap Openingspost van forum (FAD based)
FADhandleiding Find-a-Drug
FADdict monitor progie voor FAD
FokschaapTBU upload stats voor FAD
RAHhandleiding NEW Rosetta@Home!!